小笠原研究委員会は、「小笠原研究年報」と「Ogasawara Research（小笠原研究）」の２種類の出版物を刊行している。「小笠原研究年報」は様々な分野・機関での研究の交流と、本学の小笠原研究成果などに関する情報を広く一般に提供することを目的とし、毎年３月に刊行する。印刷部数は７００である。原稿〆切は１２月２０日とする。「Ogasawara Research（小笠原研究）」は原則として１論文１冊として主に英文の研究論文や総説を不定期に逐次刊行する。印刷部数は６００で、うち１００部は執筆者渡し。両出版物とも原稿は主として編集委員会より依頼するが、自由な投稿も歓迎する。既刊号の入手に関する問い合わせ先は小笠原研究委員会総務担当（理工学研究科・可知）である。